MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae genomovar. CFP2 plasmid pCFPG2

Total Repeats: 551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011561	A	7	7	31	37	100 %	0 %	0 %	0 %	212550260
2	NC_011561	TAA	2	6	69	74	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550260
3	NC_011561	A	7	7	184	190	100 %	0 %	0 %	0 %	212550260
4	NC_011561	ATCAA	2	10	290	299	60 %	20 %	0 %	20 %	212550260
5	NC_011561	CT	3	6	305	310	0 %	50 %	0 %	50 %	212550260
6	NC_011561	ATT	2	6	315	320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
7	NC_011561	TAT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
8	NC_011561	TTA	2	6	445	450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
9	NC_011561	ATT	2	6	531	536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
10	NC_011561	AGA	2	6	545	550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
11	NC_011561	AGA	2	6	570	575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
12	NC_011561	A	8	8	599	606	100 %	0 %	0 %	0 %	212550260
13	NC_011561	AG	3	6	655	660	50 %	0 %	50 %	0 %	212550260
14	NC_011561	AGG	2	6	729	734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	212550260
15	NC_011561	GAA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
16	NC_011561	GTT	2	6	826	831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550260
17	NC_011561	TTC	2	6	842	847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550260
18	NC_011561	AGTA	2	8	904	911	50 %	25 %	25 %	0 %	212550260
19	NC_011561	AAG	2	6	997	1002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
20	NC_011561	AGA	2	6	1056	1061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
21	NC_011561	CAG	2	6	1102	1107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	212550260
22	NC_011561	ATC	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550260
23	NC_011561	ATT	2	6	1145	1150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
24	NC_011561	ATT	2	6	1160	1165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550260
25	NC_011561	GAA	2	6	1180	1185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550260
26	NC_011561	ATTC	2	8	1246	1253	25 %	50 %	0 %	25 %	212550260
27	NC_011561	TAA	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550260
28	NC_011561	A	6	6	1292	1297	100 %	0 %	0 %	0 %	212550260
29	NC_011561	GAAA	2	8	1328	1335	75 %	0 %	25 %	0 %	212550260
30	NC_011561	GCT	2	6	1345	1350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550260
31	NC_011561	TGAA	2	8	1430	1437	50 %	25 %	25 %	0 %	212550260
32	NC_011561	TGAA	2	8	1445	1452	50 %	25 %	25 %	0 %	212550260
33	NC_011561	A	8	8	1484	1491	100 %	0 %	0 %	0 %	212550260
34	NC_011561	TAG	2	6	1524	1529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550260
35	NC_011561	TA	3	6	1537	1542	50 %	50 %	0 %	0 %	212550260
36	NC_011561	A	6	6	1660	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	212550261
37	NC_011561	TTATT	2	10	1676	1685	20 %	80 %	0 %	0 %	212550261
38	NC_011561	GGAGCT	2	12	1702	1713	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	212550261
39	NC_011561	TGA	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550261
40	NC_011561	CTA	2	6	1752	1757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550261
41	NC_011561	GA	3	6	1814	1819	50 %	0 %	50 %	0 %	212550261
42	NC_011561	GATG	2	8	1859	1866	25 %	25 %	50 %	0 %	212550261
43	NC_011561	TGG	2	6	1869	1874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550261
44	NC_011561	GAA	3	9	1905	1913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550261
45	NC_011561	A	6	6	1972	1977	100 %	0 %	0 %	0 %	212550261
46	NC_011561	A	6	6	1995	2000	100 %	0 %	0 %	0 %	212550261
47	NC_011561	TGA	2	6	2043	2048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550261
48	NC_011561	AATT	2	8	2055	2062	50 %	50 %	0 %	0 %	212550261
49	NC_011561	ATT	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550262
50	NC_011561	T	6	6	2206	2211	0 %	100 %	0 %	0 %	212550262
51	NC_011561	ATG	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550262
52	NC_011561	TGA	2	6	2284	2289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550262
53	NC_011561	AAG	2	6	2425	2430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550262
54	NC_011561	AG	4	8	2429	2436	50 %	0 %	50 %	0 %	212550262
55	NC_011561	AGA	2	6	2479	2484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550262
56	NC_011561	CAA	2	6	2604	2609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	212550262
57	NC_011561	CCA	2	6	2622	2627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	212550262
58	NC_011561	AT	3	6	2628	2633	50 %	50 %	0 %	0 %	212550262
59	NC_011561	TAAG	2	8	2709	2716	50 %	25 %	25 %	0 %	212550262
60	NC_011561	GGAA	2	8	3261	3268	50 %	0 %	50 %	0 %	212550263
61	NC_011561	GACA	2	8	3365	3372	50 %	0 %	25 %	25 %	212550263
62	NC_011561	TTATCG	2	12	3373	3384	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	212550263
63	NC_011561	GATG	2	8	3439	3446	25 %	25 %	50 %	0 %	212550263
64	NC_011561	TAA	2	6	3448	3453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550263
65	NC_011561	TTC	2	6	3459	3464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550263
66	NC_011561	TCT	2	6	3468	3473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550263
67	NC_011561	AGA	2	6	3607	3612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550263
68	NC_011561	GAA	2	6	3728	3733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550263
69	NC_011561	AGAT	2	8	3816	3823	50 %	25 %	25 %	0 %	212550263
70	NC_011561	AAG	2	6	3881	3886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550263
71	NC_011561	A	6	6	3962	3967	100 %	0 %	0 %	0 %	212550263
72	NC_011561	GAAT	2	8	3971	3978	50 %	25 %	25 %	0 %	212550263
73	NC_011561	TTC	2	6	4093	4098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550264
74	NC_011561	T	6	6	4152	4157	0 %	100 %	0 %	0 %	212550264
75	NC_011561	TGG	2	6	4321	4326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550264
76	NC_011561	TG	3	6	4358	4363	0 %	50 %	50 %	0 %	212550264
77	NC_011561	AGGA	2	8	4373	4380	50 %	0 %	50 %	0 %	212550264
78	NC_011561	GAA	2	6	4414	4419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550264
79	NC_011561	TCT	2	6	4426	4431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550264
80	NC_011561	AGA	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	212550264
81	NC_011561	CTAC	2	8	4683	4690	25 %	25 %	0 %	50 %	212550265
82	NC_011561	TC	3	6	4716	4721	0 %	50 %	0 %	50 %	212550265
83	NC_011561	GATT	2	8	4729	4736	25 %	50 %	25 %	0 %	212550265
84	NC_011561	CTCTC	2	10	4737	4746	0 %	40 %	0 %	60 %	212550265
85	NC_011561	ATGG	2	8	4758	4765	25 %	25 %	50 %	0 %	212550265
86	NC_011561	ATCT	2	8	4779	4786	25 %	50 %	0 %	25 %	212550265
87	NC_011561	TCT	2	6	4798	4803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550265
88	NC_011561	TA	3	6	4851	4856	50 %	50 %	0 %	0 %	212550265
89	NC_011561	GTA	2	6	4863	4868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550265
90	NC_011561	GAT	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550265
91	NC_011561	TTG	2	6	4932	4937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550265
92	NC_011561	CT	3	6	4965	4970	0 %	50 %	0 %	50 %	212550265
93	NC_011561	TTTC	2	8	5027	5034	0 %	75 %	0 %	25 %	212550265
94	NC_011561	ATTA	2	8	5130	5137	50 %	50 %	0 %	0 %	212550265
95	NC_011561	TGA	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	212550265
96	NC_011561	TAGT	2	8	5164	5171	25 %	50 %	25 %	0 %	212550265
97	NC_011561	TCT	2	6	5197	5202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550265
98	NC_011561	CCT	2	6	5222	5227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550265
99	NC_011561	TA	3	6	5238	5243	50 %	50 %	0 %	0 %	212550265
100	NC_011561	CTTTCG	2	12	5267	5278	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	212550265
101	NC_011561	TTC	2	6	5421	5426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550265
102	NC_011561	TCT	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550265
103	NC_011561	ATC	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550265
104	NC_011561	TGT	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	212550265
105	NC_011561	TTC	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550265
106	NC_011561	A	6	6	5691	5696	100 %	0 %	0 %	0 %	212550266
107	NC_011561	T	7	7	5715	5721	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
108	NC_011561	TAT	2	6	5739	5744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550266
109	NC_011561	TCT	2	6	5755	5760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550266
110	NC_011561	GATT	2	8	5765	5772	25 %	50 %	25 %	0 %	212550266
111	NC_011561	CCT	2	6	5773	5778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550266
112	NC_011561	T	6	6	5782	5787	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
113	NC_011561	TCT	2	6	5803	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550266
114	NC_011561	CAT	2	6	5816	5821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550266
115	NC_011561	T	6	6	5850	5855	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
116	NC_011561	TAATTC	2	12	5880	5891	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	212550266
117	NC_011561	TAT	2	6	5912	5917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550266
118	NC_011561	AAT	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550266
119	NC_011561	CT	3	6	5938	5943	0 %	50 %	0 %	50 %	212550266
120	NC_011561	TGC	2	6	5967	5972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	212550266
121	NC_011561	GACAA	2	10	6036	6045	60 %	0 %	20 %	20 %	212550266
122	NC_011561	AT	3	6	6068	6073	50 %	50 %	0 %	0 %	212550266
123	NC_011561	T	8	8	6073	6080	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
124	NC_011561	CTC	2	6	6086	6091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	212550266
125	NC_011561	TCT	2	6	6096	6101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550266
126	NC_011561	T	8	8	6101	6108	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
127	NC_011561	AT	3	6	6158	6163	50 %	50 %	0 %	0 %	212550266
128	NC_011561	ATT	2	6	6196	6201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	212550266
129	NC_011561	TCT	2	6	6220	6225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550266
130	NC_011561	TCTA	2	8	6282	6289	25 %	50 %	0 %	25 %	212550266
131	NC_011561	A	6	6	6319	6324	100 %	0 %	0 %	0 %	212550266
132	NC_011561	T	6	6	6332	6337	0 %	100 %	0 %	0 %	212550266
133	NC_011561	GGT	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	212550266
134	NC_011561	CTT	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	212550266
135	NC_011561	TAAA	2	8	6468	6475	75 %	25 %	0 %	0 %	212550266
136	NC_011561	AAT	2	6	6500	6505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550266
137	NC_011561	CTA	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	212550266
138	NC_011561	ATTGAA	2	12	6549	6560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	212550266
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142	NC_011561	CCATT	2	10	6787	6796	20 %	40 %	0 %	40 %	212550266
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147	NC_011561	CTTT	2	8	7157	7164	0 %	75 %	0 %	25 %	212550266
148	NC_011561	TATT	2	8	7193	7200	25 %	75 %	0 %	0 %	212550266
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271	NC_011561	ATA	2	6	14577	14582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	212550271
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278	NC_011561	AT	3	6	15392	15397	50 %	50 %	0 %	0 %	212550272
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